La vegetación acuática forma una franja no continua alrededor del lago donde se encuentra un conjunto de comunidades vegetales que ocupan los terrenos inundados temporalmente o en donde el agua alcanza poca profundidad. En la parte más externa del lago, cerca de tierra firme, se desarrolla una comunidad densa de hidrófitas emergentes compuestas por el tule, carrizo y chuspata; así como: Eleocharis montevidensis, Sagitaria graminea, Sagitaria latifolia, Scyrpus americanus, Scyrpus validus, Typha domingensis y Typha latifolia. Conforme aumenta la profundidad del agua la comunidad anterior se hace menos densa y aparecen plantas acuáticas con hojas flotantes o hidrófitas emergentes como: Eichhornia crassipes (lirio), Nymphaea mexicana y representantes de los géneros Lemna, Wolffia y Wolffiella. Finalmente, en las aguas más profundas se encuentran plantas acuáticas sumergidas como Ceratophyllum demersum o cola de borrego, Najas guadalupensis y Potamogeton illinoensis.

 

 
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