Es un producto que permite responder a las preguntas acerca de las relaciones dadas entre los recursos naturales, el medio ambiente y la actividad humana en el Lago de Chapala.
El enfoque integral del Atlas ofrece información adecuada para orientar los procesos de planeación y toma de decisiones en la cuenca directa del lago de Chapala , sobre los programas relacionados al manejo de la cuenca, el abastecimiento y calidad del agua, los programas de conservación y reforestación, la localización de plantas de tratamiento y la disposición de las aguas residuales, entre otros.