El proyecto de investigación Región Transfronteriza México-Guatemala es una iniciativa científica en cooperación con COLEF, CIDE, CIESAS, Instituto Mora, ECOSUR, FLACSO Guatemala, Universidad de San Carlos en Guatemala y CentroGeo, que tiene como objetivo realizar un diagnóstico y análisis de las condiciones del desarrollo regional transfronterizo entre ambas regiones, con una perspectiva multidisciplinaria que permita identificar y evaluar sus principales procesos constitutivos de naturaleza institucional, económica, social, cultural y ambiental; identificando especialmente, los principales puntos de atención y sus potencialidades para mejorar las condiciones de vida de sus habitantes.